На фронт ушли недавние выпускники Худпрома (художественно-промышленный техникум): М. Ф. Гладунов, Н. Ф. Кликушин, Н. А. Кузьмин, П. С. Мухин, А. Е. Оськин, И. Я. Сивохин, А. В. Юров. В годы Великой Отечественной войны художественная жизнь в далеком от фронта сибирском городе не прекращалась, хотя теперь она велась по законам военного времени. С началом войны Художественное училище закрылось. Последний директор училища – Т. П. Козлов осенью 1941 года возглавил мастерскую по выпуску агитплакатов «Окна ТАСС». В кооперативном товариществе «Омхудожник» работали К. П. Белов, А. М. Дубровский и К. Н. Щёкотов. Омский областной музей изобразительных искусств был на несколько лет законсервирован, так как его помещение использовалось в военных целях. Коллекция была эвакуирована в пристройку краеведческого музея, финансирование и штат сокращены. Однако музей всё же работал.
В 1943 г. по распоряжению Народного комиссариата просвещения РСФСР проводилась инвентаризация музейных фондов. В районах области устраивались выставки репродукций, а в 1944 г. в пяти освободившихся залах музея была организована выставка русского искусства из фондов музея. Музей тесно сотрудничал с Союзом художников, помогал устраивать выставки, финансировал выезды художников на натуру в районы Омской области. В 1941 году при музее была организована городская художественная студия, возглавляемая директором А. С. Окушко. Руководителями двух групп в студии были А. Н. Либеров, вернувшийся в 1942 году с Калининского фронта, и эвакуированный из Москвы художник Б. Н. Дейкин. Среди учеников студии были будущие известные омские художники В. Н. Белов, Б. Н. Николаев, Е. А. Куприянов, А. Б. Сапожников, А. Ф. Соловьёва, Р. Ф. Черепанов, заявившие о себе в 1960-е годы. Наибольшее распространение получили оперативные формы работы: выставки. Эвакуированные из европейской части страны живописцы В. Г. Андреев, Л. М. Афанасьев, Б. Н. Дейкин А. П. Маюхин, И. Г. Сегаль, Е. П. Тимошенко, графики А. Ф. Билль, Л. Д. Ясин; скульпторы С. С. Алешин, С. Б. Велихова, И. А. Кузнецов, прикладники А. Я. Быховский и Е. В. Савкова вместе с местными художниками устраивали выставки, площадкой для которых становились заводы, госпитали, занявшие здания школ, художественного училища. Так, на передвижную выставку для омских госпиталей было выбрано 200 работ – этюды, рисунки, варианты картин, эскизы (картины К. П. Белова «Лиза Чайкина», Б. Н. Дейкина «Отомстим!», литографии харьковчанина Л. Д. Ясина «Борьба за населенный пункт» и «Партизаны», автолитографию московской художницы А. Ф. Билль «Письма раненым»). На заводе «Прогресс» прошла выставка художника-фронтовика А. Н. Либерова (эскизы и наброски «Оккупант», «В тылу у противника», «По следам отступающих», «После битвы», портрет гвардии генерал-майора П. Г. Чанчибадзе). В 1944 г. Либеров на выставке показал картину, написанную по фронтовым впечатлениям, – «Танковый десант». В Доме Красной армии омичи могли полюбоваться настенными панно «Брусиловский прорыв», «Сталинград», «Салют» К. П. Белова, Б. Н. Дейкина и А. Н. Либерова. На областной художественной выставке 1945 г. экспонировались картины К. П. Белова «Пленные» и «Разгрузка леса на Иртыше», Т. П. Козлова «Совинформбюро», эскиз К. Н. Щекотова на тему «Зоя Космодемьянская», А. Н. Либеров выставил эскизы картины, посвященной рабочему одного из омских предприятий.
